В апреле климат в Холмогорах можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в апреле 2 градуса тепла. В среднем в апреле в Холмогорах 15 дождливых, 11 пасмурных, 3 со снегом и 1 ясный день. Дожди преимущественно умеренные. В апреле, а также в январе и октябре Холмогоры cчитается местом, некомфортным для посещения.