В сентябре климат в Каратобе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 21 градус тепла. В среднем в сентябре в Каратобе 16 ясных, 9 с переменной облачностью, 4 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в мае и июне Каратобе cчитается местом, комфортным для посещения.