В сентябре климат в Черняховске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Черняховске 13 дней с переменной облачностью, 8 ясных, 7 дождливых и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно слабые.