Сентябрь в Ботуобуйинском наслеге — самый пасмурный месяц в году. В сентябре климат в Ботуобуйинском наслеге можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 9 градусов тепла. В среднем в сентябре в Ботуобуйинском наслеге 11 пасмурных, 8 дождливых, 8 с переменной облачностью и 3 ясных дня. Дожди преимущественно слабые.