Сентябрь в Байкаловске — самый дождливый месяц в году. В сентябре климат в Байкаловске можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 5 градусов тепла. В среднем в сентябре в Байкаловске 19 дождливых, 9 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и августе Байкаловск cчитается местом, некомфортным для посещения.