В сентябре климат в Акюрейри можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 6 градусов тепла. В среднем в сентябре в Акюрейри 25 дождливых, 4 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Акюрейри cчитается местом, некомфортным для посещения.